De Federatie Groene Heuvelrug heeft werkgroepen die initiatieven nemen binnen de verschillende aandachtsgebieden:

De werkgroep bebouwd gebied gaat over alles binnen de rode contouren.

De werkgroep buitengebied verzorgt projecten binnen de groene contouren.

De werkgroep erfgoed houdt zich bezig met alle aspecten die het karakter van de Utrechtse Heuvelrug bepalen.